输入是公钥、消息（或其摘要）、签名以及算法及其参数；输出为有效或无效。严格的验证器还会拒绝格式错误的输入：非最小长度的 DER 编码、超出 1…n−1 范围的 r 或 s、不小于群的阶的 EdDSA S、长度错误的原始签名、不在曲线上的点，以及类型错误的密钥。
生产环境中大多数“invalid signature”错误都与密码学无关：被签名的字节不同（JSON 被重新序列化、空白或换行符被改动、缺少末尾换行），使用了不同的哈希，DER 签名被交给了只接受原始格式的验证器（或者反过来），曲线或 PSS 盐长度不一致，或者选错了密钥。逐一检查每个输入；签名验证工具会显示它所用的曲线、哈希和编码。
能防止实际攻击得逞的安全规则：在验证方固定算法，而不是从消息中读取算法（JWT alg，RFC 8725 §3.1）；先验证，再解析载荷或根据载荷执行操作；验证密钥与身份之间的绑定（证书路径验证、JWKS kid、known_hosts）；对于共识系统，要固定一套验证规则，因为各个库在 EdDSA 带余因子检查等边界情况上并不一致。