FIPS 203 Anhang C listet die Änderungen auf, die das Verhalten bei Eingabe und Ausgabe verändern: Das gemeinsame Geheimnis ist auf 256 Bit festgelegt; die Fujisaki-Okamoto-Variante bezieht das Chiffrat nicht mehr per Hash in das gemeinsame Geheimnis ein; die Kapselung hasht ihren anfänglichen Zufall nicht mehr; explizite Prüfungen der Eingaben kamen hinzu; und nach dem Entwurf von 2023 wurde die Schlüsselerzeugung um Domain-Separation ergänzt, damit ein Seed nicht über verschiedene Sicherheitsniveaus hinweg wiederverwendet werden kann.
Wegen dieser Änderungen erzeugen Kyber und ML-KEM aus denselben Eingaben unterschiedliche Geheimnisse. In TLS wurde die vorstandardisierte Gruppe X25519Kyber768Draft00 (0x6399) durch X25519MLKEM768 (0x11EC) ersetzt; Chrome wechselte mit Version 131 (November 2024). Bibliotheken und Konfigurationsdateien, die noch „Kyber“ schreiben, können beides meinen; prüfe also den Codepoint oder die Parameternamen.