Os formatos variam conforme a plataforma: Authenticode para arquivos PE, MSI e PowerShell do Windows; assinaturas de código da Apple com certificados Developer ID e notarização; os esquemas de assinatura de APK no Android; assinatura de JAR no Java; assinaturas de repositórios RPM e Debian com OpenPGP; assinaturas de imagens de contêiner com cosign; UEFI Secure Boot, com sua própria hierarquia de chaves. Os carimbos do tempo permitem que as assinaturas sobrevivam aos certificados que as criaram.
Os certificados de assinatura de código publicamente confiáveis seguem os Code Signing Baseline Requirements do CA/Browser Forum: desde 1º de junho de 2023, a chave privada deve ser gerada e mantida em um módulo de hardware (no mínimo FIPS 140-2 nível 2 ou Common Criteria EAL 4+), e, a partir de 1º de março de 2026, a validade máxima do certificado é de 460 dias (votação CSC-31).
Chaves de assinatura roubadas são um vetor de ataque recorrente (os certificados dos drivers do Stuxnet, o comprometimento do servidor de build da Adobe em 2012), por isso chaves mantidas em hardware, serviços de assinatura separados e planos de revogação importam mais do que a escolha do algoritmo.